Vezirköprü İlçesi, etrafı dağlık alanlarla çevrili bir yerleşim alanına sahiptir. İlçe'nin alçak kesimleri havza tabanı düzlüklerine karşılık gelmektedir. Güneydeki dağlık sahanın en önemli kütlelerinden biri Tavşan Dağı; diğeri ise bir anlamda onun batıya doğru bir uzantısı olan Dip Dağı kütlesidir. Tavşan Dağı araştırma sahasının güneyinde yer alan ve Merzifon Depresyonu ile Vezirköprü Havzasını ayıran doğal bir sınırdır. Doruk noktaları 1900 m.'yi bulmaktadır (Yuvalı T. 1901 m.).

         Kunduz Dağı, doğu-batı uzanımlı ve en yüksek zirvesi 1791 m yükseltiye sahiptir. Kunduz Dağı'nın kuzeyi Kürtler Çayı'nın yukarı çığırındaki kolları tarafından parçalanmıştır. Vezirköprü Depresyonu kuzeyindeki dağlık saha, Canik Dağları'nın doğusu ile İsfendiyar Dağları'nın batısını teşkil etmektedir. Vezirköprü’nün kesimlerini kapsayan dağlık saha, ufki olarak dalgalı bir görünümden çok, bir aşınım düzlüğü özelliği gösterir. Bu kesimdeki yapının içerisinde yayılış gösteren kireçtaşları, dik yamaçlı, eğimli, yüksek tepelerine karşılık gelmektedirler (Kepezçal T.-1200 m., Kuruçalı T.-1174 m., Kuzulukçal T.-1099 m., Eğerçal T.-873 m., Kuzkaya T.-1168 m., Alankaya T.-946 m., Şimşir T.-785 m., Sarnıç T.-808 m., Delikkaya T.-597 m.).

Aladağ ve Sıralıdağ arasındaki kesim, ilçenin doğusuna karşılık gelmektedir. En yüksek tepesi Aladağlar üzerinde Killik T. (1194 m) ile Çakıralan Tepesi'dir(1226 m). Vezirköprü ilçesinde platoluk alanlar, dağlık sahalar ile havza tabanları arasında izlenmektedir

         Vezirköprü şehrinin de kurulduğu havza tabanını Vezirköprü Ovası meydana getirmektedir. Vezirköprü Ovası, 350 m ve daha aşağı yükseltilerde yer almaktadır.

         Vezirköprü İlçe merkezinin doğu ve güneydoğusunda bulunan akarsular boğaz görünümlü vadilerden geçerek, taşıdıkları malzemeyi yörenin ana akarsuyu durumunda bulunan Akçay ve devamındaki Altınkaya Baraj Gölüne ulaştırmaktadır. Tipik birer birleştirme boğazı veya yarmavadi özelliği gösteren Varadoy ve Kayalı Boğazları, Vezirköprü’nün morfografyasında önemli bir yere sahiptir. Ayrıca İlçe'nin kuzeydoğusunda Vezirköprü şehir merkezine 17 km. uzaklıkta bulunan Şahinkaya Yarmavadisi, Altınkaya Baraj Gölü’nü adeta ikiye ayıran doğa harikası bir boğazdır.